Cada yucayeque tenía un líder religioso llamado bohique. El bohique era un nitaíno que actuaba como sacerdote, médico y maestro del poblado.      El bohique era una persona muy importante en la aldea. Además de médico, sacerdote, y maestro, servía como consejero del cacique. Como médico, conocía las propiedades medicinales de muchas plantas. Con ellas, trataba de curar a los enfermos, por eso se dice que los bohiques eran grandes herbolarios.

Los taínos eran politeístas, pero tenían un dios principal al que llamaban Yucahu Guama o Yucahu Bagua Maorocoti (lo que conocemos hoy como Yukiyú). Este era un ser de la yuca-mar, sin antecesor masculino. Yukiyú era la máxima deidad, un dios bueno que ayudaba a los taínos. Y era representado por figuras de forma trigonolita a las que llamaban cemíes. Había otro dios que representaba las fuerzas del mal y traía destrucción. A éste se le llamaba Juracán.